An Evolutionary and Phylogenetic Study of the BMP15 Gene

نویسندگان

  • G.R. Dashab Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Zabol, Zabol, Iran
  • M. Mahdavi Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, University of Zabol, Zabol, Iran|Razi Vaccine and Serum Research Institute, Karaj, Iran
چکیده مقاله:

DNA sequence data contains a wealth of biologically useful information. Recent innovations in DNA sequencing technology have greatly increased our capacity to determine massive amounts of nucleotide sequences. These sequences can be used to specify the characteristics of different regions, interpret the evolutionary relationships between categorized groups, likelihood of performing multiple comparisons between an unidentified sequence and millions of specified sequences existing in DNA information gene banks. This study focuses on bioinformatics analysis of molecular genetic variation of the BMP15 gene of some selected mammalian species with a view to providing relevant genetic information for breeding and selection programs in the studied species using computational methods. A total of twenty-three BMP15 nucleotide sequences and amino acids sequences were retrieved from the NCBI gene bank. Sequence alignment, pair and multi-alignment comparison of the BMP15 gene of the various species were done with MEGA6. High degree of polymorphism of the BMP15 gene was observed among the studied species. Despite high polymorphism in BMP15 similarity between sequences was greater than 98% and differences existing in fertility rates among species may be species-specific due to differences in the processing of BMP15. The mean diversity among populations and the scattering coefficient of evolution in the BMP15 position were calculated to be 2.15 and 1.25 bp, respectively and the mean divergence was calculated to be 1.7 bp. Also, the mean divergence within the species was 4.1, 0.4 and 2.1 bp in sheep, cows and goats, respectively. Bases substitution rate and pattern in BMP15 showed that cows and goats have the minimum genetic distance and human has the maximum genetic distance with sheep. In addition to existing variation in DNA and amino acids sequences between BMP15 in different species, this study highlighted specific segments significantly more conserved in BMP15 from mono-ovulating as compared to super-ovulating species.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

an investigation about the relationship between insurance lines and economic growth; the case study of iran

مطالعات قبلی بازار بیمه را به صورت کلی در نظر می گرفتند اما در این مطالعه صنعت بیمه به عنوان متغیر مستفل به بیمه های زندگی و غیر زندگی شکسته شده و هم چنین بیمه های زندگی به رشته های مختلف بیمه ای که در بازار بیمه ایران سهم قابل توجهی دارند تقسیم میشود. با استفاده از روشهای اقتصاد سنجی داده های برای دوره های 48-89 از مراکز ملی داده جمع آوری شد سپس با تخمین مدل خود بازگشتی برداری همراه با تعدادی ...

15 صفحه اول

the study of aaag repeat polymorphism in promoter of errg gene and its association with the risk of breast cancer in isfahan region

چکیده: سرطان پستان دومین عامل مرگ مرتبط با سرطان در خانم ها است. از آنجا که سرطان پستان یک تومور وابسته به هورمون است، می تواند توسط وضعیت هورمون های استروئیدی شامل استروژن و پروژسترون تنظیم شود. استروژن نقش مهمی در توسعه و پیشرفت سرطان پستان ایفا می کند و تاثیر خود را روی بیان ژن های هدف از طریق گیرنده های استروژن اعمال می کند. اما گروه دیگری از گیرنده های هسته ای به نام گیرنده های مرتبط به ا...

15 صفحه اول

wuthering heights and the concept of marality/a sociological study of the novel

to discuss my point, i have collected quite a number of articles, anthologies, and books about "wuthering heights" applying various ideas and theories to this fantastic story. hence, i have come to believe that gadamer and jauss are rightful when they claim that "the individaul human mind is the center and origin of all meaning," 3 that reading literature is a reader-oriented activity, that it ...

15 صفحه اول

a case study of the two translators of the holy quran: tahereh saffarzadeh and laleh bakhtiar

بطورکلی، کتاب های مقدسی همچون قران کریم را خوانندگان میتوان مطابق با پیش زمینه های مختلفی که درند درک کنند. محقق تلاش کرده نقش پیش زمینه اجتماعی-فرهنگی را روی ایدئولوژی های مترجمین زن و در نتیجه تاثیراتش را روی خواندن و ترجمه آیات قرآن کریم بررسی کند و ببیند که آیا تفاوت های واژگانی عمده ای میان این مترجمین وجود دارد یا نه. به این منظور، ترجمه 24 آیه از آیات قرآن کریم مورد بررسی مقایسه ای قرار ...

15 صفحه اول

the study of practical and theoretical foundation of credit risk and its coverage

پس از بررسی هر کدام از فاکتورهای نوع صنعت, نوع ضمانت نامه, نرخ بهره , نرخ تورم, ریسک اعتباری کشورها, کارمزد, ریکاوری, gdp, پوشش و وثیقه بر ریسک اعتباری صندوق ضمانت صادرات ایران مشخص گردید که همه فاکتورها به استثنای ریسک اعتباری کشورها و کارمزد بقیه فاکتورها رابطه معناداری با ریسک اعتباری دارند در ضمن نرخ بهره , نرخ تورم, ریکاوری, و نوع صنعت و ریسک کشورها اثر عکس روی ریسک اعتباری داردو پوشش, وثی...

15 صفحه اول

investigating the relationship between ambiguity tolerance and willingness to translate of iranian prospective english translators: an sem revalidation study

cognitive studies of translation process have recently been awarded a great deal of attention. there exists a psychological angle to almost all translation activities. the present study, thus, deals with analysing the relationships between iranian prospective translators tolerance for ambiguity (ta) and their willingness to translate (wtt). the research was conducted as a mixed methods study, d...

منابع من

با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده

{@ msg_add @}


عنوان ژورنال

دوره 7  شماره 2

صفحات  197- 209

تاریخ انتشار 2017-06-01

با دنبال کردن یک ژورنال هنگامی که شماره جدید این ژورنال منتشر می شود به شما از طریق ایمیل اطلاع داده می شود.

کلمات کلیدی

میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com

copyright © 2015-2023